Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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TrabdQ99JY4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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