Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Krcc1Q99JT5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms