Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ddb2Q99J79 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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