Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Apobec3Q99J72 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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