Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cldn16Q925N4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cldn16Q925N4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Cldn16Q925N4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cldn16Q925N4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms