Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms