Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms