Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam20bQ8VCS3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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