Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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