Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh10Q8VCH7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rdh10Q8VCH7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rdh10Q8VCH7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rdh10Q8VCH7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rdh10Q8VCH7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Rdh10Q8VCH7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh10Q8VCH7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms