Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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