Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I2

Cchcr1, Coiled-coil alpha-helical rod protein 1, mousemouse

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Length 770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cchcr1Q8K2I2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cchcr1Q8K2I2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cchcr1Q8K2I2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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