Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Znf628Q8CJ78 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms