Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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