Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc28aQ8CEI3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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