Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp27Q8CEG8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp27Q8CEG8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Usp27Q8CEG8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp27Q8CEG8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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