Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf170Q8CBG9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf170Q8CBG9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf170Q8CBG9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf170Q8CBG9 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rnf170Q8CBG9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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