Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnot2Q8C5L3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms