Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm37427-201ENSMUST00000192356 906 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Rnf212b-201ENSMUST00000218311 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm36670-202ENSMUST00000210400 1405 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim35Q8C006 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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