Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX10

Pgam5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgam5Q8BX10 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgam5Q8BX10 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgam5Q8BX10 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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