Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ctdsp2Q8BX07 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ctdsp2Q8BX07 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ctdsp2Q8BX07 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ctdsp2Q8BX07 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ctdsp2Q8BX07 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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