Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf41Q8BH75 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf41Q8BH75 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf41Q8BH75 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf41Q8BH75 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf41Q8BH75 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Rnf41Q8BH75 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf41Q8BH75 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf41Q8BH75 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf41Q8BH75 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf41Q8BH75 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf41Q8BH75 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf41Q8BH75 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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