Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Atg4dQ8BGV9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg4dQ8BGV9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms