Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ChfrQ810L3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms