Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ell3Q80VR2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ell3Q80VR2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms