Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Arhgef17Q80U35 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Arhgef17Q80U35 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Arhgef17Q80U35 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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