Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NischQ80TM9 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms