Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccp110Q7TSH4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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