Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Uhrf2Q7TMI3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Uhrf2Q7TMI3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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