Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Stambpl1Q76N33 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms