Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrimpolQ6P1E7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrimpolQ6P1E7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms