Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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