Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Taf6Q62311 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms