Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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