Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hes3Q61657 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms