Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ifi47Q61635 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms