Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gli3Q61602 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms