Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ecm1Q61508 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ecm1Q61508 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ecm1Q61508 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ecm1Q61508 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ecm1Q61508 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ecm1Q61508 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ecm1Q61508 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ecm1Q61508 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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