Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mre11Q61216 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mre11Q61216 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mre11Q61216 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Mre11Q61216 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mre11Q61216 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Mre11Q61216 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mre11Q61216 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mre11Q61216 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Mre11Q61216 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Mre11Q61216 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Mre11Q61216 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Mre11Q61216 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Mre11Q61216 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Mre11Q61216 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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