Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rbbp7Q60973 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms