Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atf3Q60765 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms