Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tdrd5Q5VCS6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tdrd5Q5VCS6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tdrd5Q5VCS6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tdrd5Q5VCS6 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tdrd5Q5VCS6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tdrd5Q5VCS6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tdrd5Q5VCS6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tdrd5Q5VCS6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tdrd5Q5VCS6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tdrd5Q5VCS6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tdrd5Q5VCS6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Tdrd5Q5VCS6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd5Q5VCS6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms