Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms