Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Trim38Q5SZ99 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Trim38Q5SZ99 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim38Q5SZ99 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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