Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm27Q5SFM8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm27Q5SFM8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms