Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc9Q3V038 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms