Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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