Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BB287469Q3UT53 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms