Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms