Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms